Detektif Conan, juga dikenal sebagai Case Closed. Pada awal cerita, 17 tahun (16 tahun di manga) siswa SMA Jimmy Kudo (Shin'ichi Kudo) menjadi anak, Conan Edogawa. Jimmy Kudo pada awal Case Closed dikenal sebagai detektif siswa SMA.Suatu hari, Jimmy pergi ke sebuah taman yang bernama "Tropical Land," dengan teman masa kecilnya (atau pacar saat ini), Rachel Moore (Ran Mori). Ia mengalami kasus dimana roller coaster penumpang, Kishida (Kenneth di anime Inggris), tewas dalam decapitation.He spektakuler berdarah memecahkan kasus ini dan di rumah kembali, ia saksi kesepakatan yang mencurigakan yang melibatkan beberapa orang berpakaian hitam lengkap. Orang lain di tempat-tempat hitam dia, mengetuk dia turun, dan memberinya racun belum teruji bernama Apotoxin-4869 (APTX4869), yang dimaksudkan untuk membunuhnya. Racun tersebut tidak membunuh dia. Namun, ketika ia datang ke indra, tubuhnya sudah menyusut ke ukuran seorang anak sekolah dasar.
Detektif Conan, mengikuti nasihat Dr Hiroshi Agasa (Dr. Herschel Agasa di anime Inggris), menyembunyikan Jimmy siapa dia sebenarnya, jangan sampai orang-orang di hitam mencari tahu bahwa dia masih hidup. Ketika Rachel meminta namanya, Jimmy bintik-bintik buku oleh Arthur Conan Doyle dan Edogawa Rampo dan datang dengan nama "Conan Edogawa." Agasa mengatakan bahwa "Conan" adalah relatif, tapi terlalu sibuk untuk mengurus seorang anak muda, dan menyarankan bahwa "Conan" tinggal bersama Rachel, dan kedua Conan dan Rachel setuju.
ayah Rachel, Richard Moore (Kogoro Mori) juga detektif, tetapi tidak terlalu mampu. Conan selalu memecahkan misteri menggantikan dia. Sebagai Conan tampaknya hanya anak laki-laki, polisi tidak membayar Conan keberatan apapun. Conan bukannya menggunakan Detektif Moore dengan menempatkan dia untuk tidur dengan "menonton anestesi pistol-" dan berpura-pura menjadi Moore dengan menggunakan voice changer menyamar sebagai dasi kupu-kupu. karakter penting lainnya yang muncul (beberapa saat kemudian) adalah orang tua Jimmy Booker (Yusaku) dan Vivian (Yukiko) Kudo, Harley Hartwell (Heiji Hattori), seorang detektif saingan dari Osaka, pria pencuri Phantom Thief Kid, yang juga muncul dalam Magic Kaito), penemu APTX4869 Shiho Miyano (codename "Sherry" dalam sindikat hitam, berubah menjadi anak juga setelah dia mengambil obat sendiri untuk melarikan diri organisasi, dan kemudian tinggal dengan Dr Agasa dengan nama barunya Ai Haibara), dan yang lainnya anggota organisasi hitam: Gin, Vodka, Tequila, Calvados, Pisco, Vermouth, Kir, Chianti, Koln, dan "bos" misterius yang hanya telah disebutkan sejauh ini.
Detektif Conan untuk mempertahankan cover-nya, Conan pergi ke sekolah dasar dan telah berteman khusus dengan tiga anak-anak di sekolah, George Kaminski, Mitch Tennison dan Amy Yeager yang membentuk gaya SMP Detektif Liga diri. Meskipun Conan merasa sangat sadar diri bermain dengan mereka karena usia yang sebenarnya, keempat orang memiliki berbagai petualangan mereka sendiri dan trio asisten normal telah terbukti mampu detektif untuk usia mereka.
